Институт был создан в 2004 году гуманитарно-методологической научной группой Ю.В. Громыко, ведущей свои разработки в России с конца 1980-х годов. Это одновременно и консалтинговая компания и фабрика мысли (think tank).

Научная традиция Института восходит к Московскому методологическому кружку (ММК) Г.П. Щедровицкого, учеником которого является Ю.В. Громыко. Также ряд научных программ Института восходит к разработкам директора Психологического института РАО В.В. Давыдовым и театрального и кино-режиссера, философа Е.Л. Шифферсом, в честь которого назван институт.